Схожая ситуация, но с водительским стеклом. Машина Toyota Duet 2000г. Пи покупке не обратил внимание, что водительское стекло при подьеме вверх поднимается и сразу опускается примерно до середины. Чего только не перепробовал, пока не нашел в инете следующее:
1. Снимаем обшивку с двери.
2. Опускаем стекло до уровня технологических отверстий и откручиваем его ( желательно стекло снять дабы не разбить.)
3. Снимаем механизм стеклоподьемника и помечаем положение шестерни рычага который опускает стекло.
4. Откручивем двигатель стеклоподьемника ( крепится на трех болтах, вместе с концевым выключателем)
5. Подключаем двигатель стеклоподьемника к фишке, и кнопкой управления стеклом даем команду "вверх", двигатель закрутиться и может сделать оборотов 6 - 7, а затем остановится.)
6. Далее прикручиваем двигатель на место, предварительно поставив положение шестерни рычага по метке которую поставили.
7. Ставим обратно стекло и прикручиваем его.
Ну и на последок проверяем как работает.
У меня получилось с первого раза.